ПО ScanImage для двухфотонной сканирующей микроскопии 

ScanImage — это программное обеспечение для обработки изображений, разработанное Карелом Свободой и его коллегами (Pologruto et al, 2003) и тщательно поддерживаемое сотрудниками лаборатории Свободы, сначала в CSHL, а затем в Janelia Farms, HHMI. Трудно переоценить влияние этого программного обеспечения на область двухфотонной сканирующей микроскопии.

ScanImage изначально разрабатывался как свободно распространяемая программа с открытым исходным кодом, и на начальном этапе её поддержка была «легкой». Однако по мере роста популярности ScanImage и необходимости в новых версиях для поддержки изменений в операционных системах и драйверах оборудования вскоре стало очевидно, что высокий уровень поддержки невозможно поддерживать, основываясь на «бесплатной модели». В конечном итоге, поддержка и разработка ScanImage стали коммерческим предприятием, а Vidrio стал новым лицом ScanImage.

Разработка двухфотонных микроскопов в Sutter Instrument уже много лет тесно связана с программным обеспечением ScanImage. Помимо двухфотонного микроскопа MOM® in vivo, компания Sutter предлагает множество продуктов, используемых специалистами по двухфотонной микроскопии, работающими с ScanImage, включая контроллеры XYZ с шаговыми двигателями, гальванометрические и резонансные сканеры, фотоэлектронные умножители (ФЭУ) и блоки питания ФЭУ. 

Компания Sutter поставляет оборудование, которое без проблем работает со всеми версиями ScanImage. Продукты можно приобрести по отдельности или в составе системы со ScanImage Premium или SI 5.

Характеристики ПО ScanImage

• Поддержка линейного гальванометра и резонансного сканирующего оборудования
• Поддержка комбинации резонансного, гальванометра и тройного сканера
• Точная экспериментальная синхронизация визуализации, физиологии и поведения с помощью определяемых пользователем триггеров и внутренних тактовых сигналов
• Полная поддержка приложений одновременной визуализации и фотостимуляции, требующих параллельных путей сканирования
• Режим многозонного интереса обеспечивает целенаправленную последовательную визуализацию и фотостимуляцию
• Сканирование нескольких произвольных линий
• Непрерывная объемная визуализация с поддержкой быстрого пьезоэлектрического воздействия (PI, nPoint)
• Пошаговая и стабильная объемная визуализация с пьезоэлектрическим воздействием или Optotune
• Непрерывный сбор данных без пропусков на базе ПЛИС для обработки изображений в реальном времени и дальнейшей обработки данных в замкнутом цикле
• Интерфейс MatLab предлагает пользовательские возможности написания сценариев и настраиваемого анализа с полным API управления оборудованием для автоматизации экспериментов
• Интеграция с WaveSurfer обеспечивает синхронизированную регистрацию данных с помощью электродов и общих данных

Информация для заказа

Системы ScanImage Premium (1) — Включает SIP-SOFT, RESSCAN-MOM или RESSCAN-GEN, предварительно настроенную систему сбора данных NI-FLEX RIO и два быстродействующих предусилителя FEMTO DHPCA-100 с блоками питания.

• RES-MOM-SIP Резонансный сканер для Sutter MOM со ScanImage Premium
• RES-GEN-SIP Резонансный сканер для микроскопа с кейсом 60 мм со ScanImage Premium

Системы SI 5 (1) — Включает RESSCAN-MOM или RESSCAN-GEN, предварительно настроенную систему сбора данных NI-FLEX RIO и два быстродействующих предусилителя FEMTO DHPCA-100 с блоками питания.

• RES-MOM-SI5 Резонансный сканер для Sutter MOM с SI 5
• RES-GEN-SI5 Резонансный сканер для микроскопа с кейсом 60-мм с SI 5

(1) Обратите внимание, что пакеты ScanImage Premium не являются готовыми решениями. Вам потребуется соответствующий компьютер с установленным программным обеспечением MATLAB®. MATLAB® — продукт MathWorks.

КОМПОНЕНТЫ SCANIMAGE

• RESSCAN-MOM Резонансный сканер для Sutter MOM — автономный
• RESSCAN-GEN Резонансный сканер для микроскопа с кейсом 60-мм — автономный
• SIP-SOFT Программное обеспечение ScanImage Premium
• DAQ-FPGA Базовая система сбора данных National Instruments Flex-RIO, совместимая с бесплатным ПО SI 5 и ScanImage Premium
• O040335 Предусилитель FEMTO DHPCA-100
• O040337 Блок питания FEMTO

Применение ПО ScanImage

• 2-фотонная микроскопия
• 3P-микроскопия
• Визуализация